Воздействие гидросооружений на окружающую среду будет иметь локальный характер. Сооружение гидроэлектростанций не повлияет на формирование стока Нарына и Сырдарьи. В русло Нарына обеспечен постоянный минимальный санитарный попуск в объеме 10 кубометров в секунду. В зону затопления не попадают особо охраняемые территории. Ранее на возможные экологические последствия ссылались Узбекистан и Казахстан. Министр иностранных дел Республики Узбекистан обращал внимание Ассамблеи ООН и требовал проведения международной энергетической экспертизы проектов. Проект строительства Верхне-Нарынского каскада реализуется РусГидро согласно соглашению, подписанному 20 сентября 2012 года между правительствами России и Киргизии, напоминает пресс-служба ОАО «РусГидро». Он будет состоять из Акбулунской ГЭС, Нарынской ГЭС-1, Нарынской ГЭС-2 и Нарынской ГЭС-3, общей мощностью 237,7 МВт и выработкой 942,4 млн. кВт∙ч.